ฟันผุเริ่มต้นจากการมีเศษอาหารไปติดที่ตัวฟัน เช่น ที่ผิวร่องฟัน ในรูป สีแดงที่อยู่ที่ร่องฟันเป็นตัวแทนของเศษอาหาร 

ในขั้นตอนนี้ถ้าเราแปรงฟันเอาเศษอาหารออกไป ฟันก็จะไม่ผุ แต่ถ้าเราปล่อยเศษอาหารนั้นเอาไว้โดยไม่ขจัดออกไป หรือแปรงฟันไม่สะอาดเท่าที่ควรก็จะทำให้เกิดขั้นตอน ที่สองตามมาได้

 ในขั้นนี้จะเห็นจากในภาพได้ว่า ชั้นที่เป็นเคลือบฟันเริ่มถูกทำลายเป็นรูลงไป (สีดำในภาพ) เนื่องจากอาหาร(ส่วนที่เป็นสีแดง)ไม่ได้ถูกกำจัดออกไป และถูกปล่อยไว้นานจนเกิดเป็นกรดไปกัดกร่อนผิว เคลือบฟันขึ้น 

ฟันที่ผุในขั้นนี้หากมีการแปรงฟันที่ดีด้วยยาสีฟันี่มี ฟลูออไรด์เป็นส่วนประกอบและมีการรักษาสุขภาพ ช่องปากที่ดี อาจจะยังไม่ต้องไปรับการอุดฟันก็ได้ แต่ถ้ายังคงละเลยไม่รักษาความสะอาดในช่องปากให้ดี ฟันก็จะผุต่อไปถึงขั้นที่ 3